La patologia clinica è una branca essenziale della medicina dei piccoli mammiferi esotici, che assiste il clinico nella formulazione di diagnosi e prognosi. Purtroppo ci sono delle difficoltà intrinseche in queste specie, che sono legate alla ridotta dimensione dei vasi e alla contenzione manuale che può rivelarsi stressante e pericolosa in animali non stabili. Inoltre, specialmente in piccoli roditori, il volume di sangue che si può ottenere senza creare scompensi emodinamici è limitato. Sono molteplici le caratteristiche tipiche ematologiche e biochimiche di queste specie. I campioni di sangue delle cavie peruviane possono presentare cellule di Kurloff, che generalmente aumentano in stati di iperestrogenismo. Le tecnologie comunemente impiegate per misurare l’albumina, come il verde di bromocresolo, non sono state validate in molti roditori, ed in generale l’elettroforesi delle proteine sieriche dovrebbe preferirsi per una valutazione accurata delle frazioni proteiche. L’accuratezza dei glucometri portatili varia a seconda delle specie e dello specifico strumento impiegato. L’utilizzo di strumenti errati può portare alla sovradiagnosi o alla mancata diagnosi di alterazioni glicemiche.